Arkapravo Chattopadhyay

---

Availability

Monday to Friday from 9:30 am to 5 pm. Location: Katz-2-020T

Area of Study / Keywords

Computational Pharmacy AI based Drug Design Personalised Medicine Generative AI Image Processing

---

About

Hello! Nomoskar! First of all, I am a Bengali boy from Barasat, Kolkata, West Bengal, living in Edmonton,Alberta,Canada.Currently, I am a Graduate Research Assistant at the University of Alberta, Edmonton, working at the intersection of computational biology, molecular modelling, and AI-driven drug discovery. My work focuses on using advanced computational and machine learning techniques to understand protein–ligand interactions, design novel therapeutics, and accelerate biomedical research. I completed my B. Tech in Computer Science & Engineering from the University of Engineering and Management, Kolkata, followed by an M.Tech in Information Technology from the Government College of Engineering and Ceramic Technology, Kolkata. These programs helped me build a strong foundation in computer science while shaping a deep interest in solving biomedical and health-related challenges through computation. Before moving into drug discovery research, I also worked extensively in medical image processing, where I developed custom CNN architectures for brain tumour classification and segmentation using MRI datasets. This experience strengthened my expertise in deep learning, image analysis, and algorithm design for real-world healthcare applications. At the University of Alberta, I am part of a collaborative research environment under Dr Khaled Barakat, where I contribute to projects involving molecular docking, molecular dynamics simulations, AI-driven modelling, and the development of computational pipelines for structural biology and biopharmaceutical research. I am passionate about bridging computer science with life sciences and leveraging technology to improve human health.Beyond research, I enjoy scientific communication, mentoring students, and staying updated on innovations in AI, structural biology, medical imaging, and precision medicine.I am always open to collaboration, networking, and interdisciplinary discussions.

French -- Version

Bonjour ! Nomoskar !

Tout d’abord, je suis un jeune homme bengali originaire de Barasat, Kolkata, au Bengale-Occidental, et je vis actuellement à Edmonton, en Alberta, au Canada. Je suis actuellement assistant de recherche diplômé à l’Université de l’Alberta, à Edmonton, où je travaille à l’intersection de la biologie computationnelle, de la modélisation moléculaire et de la découverte de médicaments assistée par l’intelligence artificielle.Mes travaux de recherche portent sur l’utilisation de techniques avancées de calcul et d’apprentissage automatique afin de comprendre les interactions protéines-ligands, de concevoir de nouvelles thérapies et d’accélérer la recherche biomédicale. J’ai obtenu mon B.Tech en informatique et ingénierie de l’Université of Engineering and Management de Kolkata, puis un M.Tech en technologies de l’information au Government College of Engineering and Ceramic Technology de Kolkata. Ces formations m’ont permis d’acquérir une solide base en informatique tout en développant un profond intérêt pour la résolution de problématiques biomédicales et liées à la santé grâce aux approches computationnelles.Avant de m’orienter vers la recherche en découverte de médicaments, j’ai également travaillé de manière approfondie en traitement d’images médicales, où j’ai développé des architectures CNN personnalisées pour la classification et la segmentation des tumeurs cérébrales à partir d’images IRM. Cette expérience a renforcé mes compétences en apprentissage profond, en analyse d’images et en conception d’algorithmes appliqués à des problématiques réelles du domaine de la santé.À l’Université de l’Alberta, je fais partie d’un environnement de recherche collaboratif sous la direction du Dr Khaled Barakat, où je contribue à des projets impliquant l’amarrage moléculaire, les simulations de dynamique moléculaire, la modélisation assistée par intelligence artificielle et le développement de pipelines computationnels pour la biologie structurale et la recherche biopharmaceutique.Je suis passionné par le rapprochement entre l’informatique et les sciences de la vie, ainsi que par l’utilisation des technologies numériques pour améliorer la santé humaine. En dehors de la recherche, j’aime communiquer la science, encadrer des étudiants et suivre les innovations dans les domaines de l’intelligence artificielle, de la biologie structurale, de l’imagerie médicale et de la médecine de précision.Je suis toujours ouvert aux collaborations, au réseautage et aux échanges interdisciplinaires.

Bengali -- Version

নমস্কার!

প্রথমেই বলি, আমি পশ্চিমবঙ্গের কলকাতার বারাসাতের একজন বাঙালি ছেলে এবং বর্তমানে কানাডার আলবার্টা প্রদেশের এডমন্টনে বসবাস করছি। বর্তমানে আমি ইউনিভার্সিটি অফ আলবার্টা, এডমন্টনে একজন Graduate Research Assistant হিসেবে কাজ করছি, যেখানে আমার গবেষণার ক্ষেত্র কম্পিউটেশনাল বায়োলজি, মলিকিউলার মডেলিং এবং কৃত্রিম বুদ্ধিমত্তা (AI)-নির্ভর ড্রাগ ডিসকভারির সংযোগস্থলে অবস্থিত।আমার গবেষণার মূল লক্ষ্য হলো উন্নত কম্পিউটেশনাল পদ্ধতি এবং মেশিন লার্নিং প্রযুক্তি ব্যবহার করে প্রোটিন–লিগ্যান্ডের পারস্পরিক ক্রিয়া (protein–ligand interaction) বোঝা, নতুন থেরাপিউটিক অণু ডিজাইন করা এবং বায়োমেডিক্যাল গবেষণার গতি ত্বরান্বিত করা।আমি কলকাতার University of Engineering and Management থেকে Computer Science & Engineering-এ B.Tech এবং Government College of Engineering and Ceramic Technology থেকে Information Technology-তে M.Tech সম্পন্ন করেছি। এই শিক্ষাজীবন আমাকে কম্পিউটার বিজ্ঞানের একটি শক্তিশালী ভিত্তি তৈরি করতে সাহায্য করেছে এবং একইসঙ্গে কম্পিউটেশনাল পদ্ধতির মাধ্যমে জীববিজ্ঞান ও স্বাস্থ্যসংক্রান্ত জটিল সমস্যার সমাধানের প্রতি গভীর আগ্রহ তৈরি করেছে।ড্রাগ ডিসকভারি গবেষণায় আসার আগে আমি মেডিক্যাল ইমেজ প্রসেসিং ক্ষেত্রেও ব্যাপকভাবে কাজ করেছি। সেখানে MRI ডেটাসেট ব্যবহার করে ব্রেন টিউমার শ্রেণিবিন্যাস (classification) এবং সেগমেন্টেশন (segmentation)-এর জন্য কাস্টম CNN আর্কিটেকচার তৈরি করেছি। এই অভিজ্ঞতা আমার ডিপ লার্নিং, ইমেজ অ্যানালাইসিস এবং বাস্তব স্বাস্থ্যসংক্রান্ত সমস্যার জন্য অ্যালগরিদম তৈরির দক্ষতাকে আরও উন্নত করেছে।ইউনিভার্সিটি অফ আলবার্টায় আমি Dr. Khaled Barakat-এর নেতৃত্বাধীন একটি সহযোগিতামূলক গবেষণা পরিবেশের অংশ। এখানে আমি মলিকিউলার ডকিং, মলিকিউলার ডায়নামিক্স সিমুলেশন, AI-ভিত্তিক মডেলিং এবং স্ট্রাকচারাল বায়োলজি ও বায়োফার্মাসিউটিক্যাল গবেষণার জন্য কম্পিউটেশনাল পাইপলাইন উন্নয়নের মতো বিভিন্ন প্রকল্পে অবদান রাখছি।কম্পিউটার বিজ্ঞান ও জীবনবিজ্ঞানের মধ্যে সেতুবন্ধন তৈরি করা এবং প্রযুক্তির মাধ্যমে মানবস্বাস্থ্যের উন্নতিতে অবদান রাখা আমার অন্যতম প্রধান লক্ষ্য। গবেষণার পাশাপাশি আমি বিজ্ঞান যোগাযোগ (scientific communication), শিক্ষার্থীদের পরামর্শ প্রদান (mentoring) এবং কৃত্রিম বুদ্ধিমত্তা, স্ট্রাকচারাল বায়োলজি, মেডিক্যাল ইমেজিং ও প্রিসিশন মেডিসিনের সাম্প্রতিক অগ্রগতি সম্পর্কে জানতে আগ্রহী।আমি সবসময় নতুন সহযোগিতা, গবেষণামূলক যোগাযোগ এবং আন্তঃবিষয়ক আলোচনার জন্য উন্মুক্ত।

Arkapravo Chattopadhyay, Lynn C. Lunsonga, Peter E. Light, Khaled Barakat

Medicinal Research Reviews. 2026 July; 10.1002/med.70077

---

Arkapravo Chattopadhyay, Farag E.S. Mosa, Peter E. Light, Khaled Barakat

Journal of Molecular Graphics and Modelling. 2026 July; 10.1016/j.jmgm.2026.109505

---

Arkapravo Chattopadhyay, Mohammad Fatehi, Farag E. S. Mosa, Brittany Gruber, Peter E. Light, Khaled Barakat

Scientific Reports. 2025 December; 10.1038/s41598-025-30298-6

---

Lynn C. Lunsonga, Mohammad Fatehi, Wentong Long, Amy J. Barr, Brittany Gruber, Arkapravo Chattopadhyay, Khaled Barakat, Andrew G. Edwards, Peter E. Light

Journal of Molecular and Cellular Cardiology. 2025 January; 10.1016/j.yjmcc.2024.11.014

---

Arkapravo Chattopadhyay, Mausumi Maitra

2022 December; 2 (4) 10.1016/j.neuri.2022.100060

---

View additional publications

• ResearchGate